Browsing by Author "Kasprzak, Joanna"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Modelowanie struktur wielopodjednostkowych kompleksów makromolekularnych(2013-03-06) Kasprzak, Joanna; Bujnicki, Janusz M. PromotorJednym z największych wyzwań współczesnej biologii strukturalnej jest poznanie funkcji i mechanizmu działania kompleksów makromolekularnych. Przykładem mogą być maszyny makromolekularne takie jak spliceosom, dla którego znany jest kształt całego kompleksu, skład podjednostkowy i dokładna struktura wielu elementów, ale brakuje metod, pozwalających wymodelować kompletną strukturę. Rozwiązanie struktur za pomocą technik doświadczalnych dla dużych kompleksów jest bardzo trudne, kosztowne i zajmuje dużo czasu. Niejednokrotnie, dla mało stabilnych struktur, nie udaje się w ogóle otrzymać struktury. W takich przypadkach jedyną możliwością jest zastosowanie metod komputerowych, służących do szybkiego przeszukiwania przestrzeni możliwych rozwiązań zdefiniowanych przez więzy pochodzące z badań doświadczalnych. W niniejszej pracy doktorskiej przedstawiono program PyRy3D, oparty na założeniach modelowania hybrydowego, który pozwala na wykorzystanie różnych danych doświadczalnych w procesie modelowania struktury. Procedura modelowania kompleksu do przeszukiwania przestrzeni rozwiązań wykorzystuje podejście Monte Carlo. Podejście zastosowane w PyRy3D umożliwia konstruowanie modeli o niskiej rozdzielczości także dla bardzo dużych kompleksów, nawet gdy brakuje danych strukturalnych dla pojedynczych komponentów.