Browsing by Author "Plewka, Patrycja"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Transkrypty genów tRNA i tRNA-podobnych i pochodzące z nich małe RNA u Arabidopsis thaliana(2019) Plewka, Patrycja; Jarmołowski, Artur. PromotorTransportowe RNA (tRNA) odgrywają kluczową rolę w dekodowaniu informacji genetycznej zawartej w sekwencji zasad DNA. Poza genami kodującymi klasyczne cząsteczki tRNA, zidentyfikowano także szeroką gamę sekwencji podobnych do tRNA, które posiadają tylko pewne cechy strukturalne charakterystyczne dla kanonicznych tRNA (TLS, ang. tRNA-like sequences). Ostatnie badania dowodzą, że tRNA mogą również stanowić źródło małych RNA (ang. tRF, tRNA-derived fragments), które odgrywają istotną rolę w regulacji ekspresji genów. Niniejsza praca nawiązuje do różnych aspektów biologii cząsteczek tRNA. Jej wymiernym efektem było opracowanie metody masowego sekwencjonowania tRNA oraz stworzenie pierwszego, eksperymentalnie sprawdzonego atlasu aktywnych transkrypcyjnie genów tRNA w siewkach roślin Arabidopsis. Druga część rozprawy to studium przypadku, szczegółowa charakterystyka struktury, biogenezy i roli cząsteczki tRNA-podobnej pochodzącej z intronu długiego niekodującego RNA GUT15 (lncRNA, ang. long noncoding RNA GUT15). Wykazano negatywny wpływ tej struktury na splicing jej intronu gospodarza. Ponadto, dowiedziono, że obecność klasycznych tRNA w intronach genów kodujących białka nie zaburza ich splicingu. W ramach trzeciej części rozprawy, przeprowadzono głębokie sekwencjonowanie małych RNA w celu identyfikacji i charakterystyki cząsteczek tRF pochodzących z mutantów genów metabolizmu RNA. Uzyskane rezultaty zostały włączone w zasoby bazy tRex, stanowiącej pierwszą bazę danych dedykowaną roślinnym cząsteczkom tRF w roślinie modelowej A. thaliana.