Browsing by Author "Skalski, Bohdan. Promotor"
Now showing 1 - 2 of 2
Results Per Page
Sort Options
Item Badania właściwości fotochemicznych azydonukleozydów purynowych w kontekście ich potencjalnego wykorzystania jako czynników fotozszywających w dwuniciowych układach oligonukleotydowych(2014-06-03) Komodziński, Krzysztof; Skalski, Bohdan. PromotorW ramach niniejszej pracy doktorskiej zsyntetyzowano szereg nukleozydów azydopurynowych i zbadano ich przemiany fotochemiczne podczas naświetlania promieniowaniem z zakresu bliskiego nadfioletu (λ > 300 nm) w roztworach wodnych, w warunkach aerobowych i anaerobowych. Stosując wysokosprawną chromatografię cieczową (HPLC) wydzielono główne fotoprodukty i w oparciu o pomiary widm 1H i 13C NMR oraz ESI-TOF MS ustalono ich struktury. Na podstawie uzyskanych wyników stwierdzono, że niezależnie od warunków naświetlania, głównym procesem jakiemu ulega 6-azydonebularyna, jest reakcja powiększenia pierścienia purynowego prowadząca do nowej pochodnej 1,3,5-triazepinowej, natomiast fotochemia pozostałych pochodnych azydopurynowych zależy od położenia grupy azydkowej i obecności dodatkowych podstawników w pierścieniu purynowym, oraz obecności tlenu. Głównymi procesami jakim ulegają 2-azydoadenozyna i 2-amino-6-azydonebularyna, w zależności od warunków naświetlania, aerobowych i anaerobowych, są fotoredukcja lub fotoutlenianie do odpowiednich amino- i/lub nitro analogów. Nie zaobserwowano w przypadku tych pochodnych reakcji powiększenia pierścienia purynowego. Zbadano reakcje fotochemiczne 6-azydopuryny w modelowych układach oligonukleotydowych i wykazano, że w układzie jednoniciowym pochodna ta ulega reakcji powiększenia pierścienia purynowego natomiast naświetlana w dupleksach DNA ulega fotoaddycji z resztą adeninową w nici komplemetarnej prowadzącej do kowalencyjnego związania obydwu łańcuchów z wydajnością sięgającą 75-80%.Item Fotochemia jedno- i dwuniciowych oligodeoksynukleotydów zawierających 5-bromouracyl w sąsiedztwie zasad pirymidynowych(2012-12-10) Lepczyńska, Jolanta; Skalski, Bohdan. PromotorW ramach niniejszej pracy doktorskiej zsyntetyzowano szereg di- i heksanukleotydów zawierających 5-bromouracyl w sąsiedztwie zasady pirymidynowej (uracylu lub tyminy) i zbadano ich fotochemię w warunkach selektywnego wzbudzenia reszty 5-bromouracylowej promieniowaniem UV o długości fali = 302 nm. Stosując wysokosprawną chromatografię cieczową (HPLC) wydzielono główne fotoprodukty i bazując na pomiarach widm 1H i 13C NMR oraz MALDI TOF MS ustalono ich struktury. W oparciu o uzyskane wyniki zaproponowano wieloetapowy mechanizm przemian fotochemicznych naświetlanych układów, w którym pierwotnym procesem fotochemicznym jest addycja [2+2] 5-bromouracylu z sąsiadującą w łańcuchu resztą pirymidynową prowadząca do niestabilnego termicznie i fotochemicznie adduktu cyklobutanowego zawierającego atom bromu w cząsteczce. Tworzący się addukt cyklobutanowy pod wpływem dalszego naświetlania ulega przekształceniu do adduktu 6-hydroksy-5,6-dihydro-5,5’-dipirymidynowego, który, z kolei, ulega dalszej, termicznej degradacji do adduktu 5,5’-diurydynylowego. Uzyskane wyniki przeczą panującemu dotychczas przekonaniu, że głównym, pierwotnym procesem fotochemicznym w modyfikowanych 5-bromouracylem układach oligonukleotydowych jest homolityczny lub też heterolityczny rozpad wiązania C5-Br i pozwalają zrozumieć w jaki sposób powstają znane wcześniej, izolowane z modyfikowanego bromouracylem DNA fotaddukty 5,5’-diurydylowe.