Browsing by Author "Dolata, Jakub"

Now showing 1 - 1 of 1
  • Item
    Funkcjonalne powiązania między strukturą chromatyny, procesywnością polimerazy RNA II oraz splicingiem alternatywnym u Arabidopsis thaliana
    (2016) Dolata, Jakub; Jarmołowski, Artur. Promotor
    Przez wiele lat proces transkrypcji oraz dojrzewania RNA rozpatrywane były niezależnie. Ostatnie badania pokazują jednak, że synteza prekursorowych RNA oraz ich obróbka to procesy silnie ze sobą powiązane, które należy rozpatrywać i badać na tle wzajemnych interakcji. Pośród procesów, których mechanizm działania i końcowy efekt jest zależny od struktury chromatyny i tempa transkrypcji przez polimerazę RNA II wymienia się jeden z ważniejszych mechanizmów regulacji ekspresji genów - splicing alternatywny. Mechanizm ten zwiększa potencjał kodujący genomu. Ta sama cząsteczka pre-mRNA jest potencjalnym źródłem kilku różnych dojrzałych mRNA, które mogą powstać na skutek wyboru alternatywnych miejsc splicingowych. U człowieka około 95% genów zawierających introny podlega alternatywnemu splicingowi. W przypadku Arabidopsis thaliana wartość ta oscyluje w granicach 60%. Ponad 75% alternatywnych zdarzeń splicingowych ma miejsce w obrębie sekwencji kodującej genu, co daje potencjalną możliwość generowania białek o zmienionej strukturze i funkcji. W wyniku realizacji projektu, podjęta została próba wykazania kluczowych czynników biorących udział w ko-transkrypcyjnej regulacji splicingu alternatywnego. Do analizy wybrano elementy chromatyny (histon łącznikowy H1.3), białka kompleksu remodelującego chromatynę SWI/SNF, czynnik transkrypcyjny wpływający na tempo polimerazy RNA II (TFIIS) oraz jeden z czynników splicingowych (NTR1). Dla wszystkich wymienionych elementów wykazano wpływ na wycinanie intronów i wybór alternatywnych miejsc splicingowych, co dowodzi słuszności twierdzenia o występowaniu ko-transkrypcyjnego splicingu u roślin.