Browsing by Author "Domagalski, Marcin"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Wyznaczenie struktury i analiza syntazy izochoryzmianu DhbC z Bacillus anthracis z wykorzystaniem innowacyjnego systemu zarządzania danymi dla Genomiki Strukturalnej(2015-07-24) Domagalski, Marcin; Bujnicki, Janusz M. Promotor; Minor, Władysław. PromotorGłównymi celami niniejszej pracy było rozwiązanie struktury przestrzennej i charakterystyka właściwości biochemicznych syntazy izochoryzmianu DhbC z B. anthracis oraz stworzenie komponentów innowacyjnego systemu zarządzania danymi doświadczalnymi „UniTrack” dla Center for Structural Genomcis of Infectious Diseases (CSGID). Struktura formy apo DhbC została rozwiązana za pomocą krystalografii rentgenowskiej pojedyńczych kryształów makromolekuł do rozdzielczości 2.4 Å. Przy pomocy analizy spektorfotometrycznej potwierdzono funkcję katalityczną enzymu oraz wyznaczono stałe kinetyczne reakcji enzymatycznej. Rozwinięte w ramach pracy komponenty systemu „UniTrack” to baza danych monitorująca postęp prac na celami białkowymi „CSGID-DB”, powiązany z nią portal internetowy zapewniający publiczny dostęp do danych i rozpowszechniający uzyskaną wiedzę, narzędzie do walidacji celów białowych, a także protokoły komunikacji z zewnętrznymi bazami danych. „UniTrack” monitoruje pracę doświadczalną nad poszczególnymi celami białkowymi i zapewnia intuicyjny przypływ pracy pomiędzy grupami badawczymi zaangażowanymi w projekt. System monitoruje również ogólny postęp prac doświadczalnych CSGID przez generowane w czasie rzeczywistym wewnętrzne raporty i statystyki jak również pliki XML, które są wykorzystywane do deponowania informacji w zewnętrznych repozytoriach.