Browsing by Author "Rosikiewicz, Marta"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Mikromacierzowa analiza transkryptomu mutanta abh1 Arabidopsis thaliana(2011-09-30T08:29:14Z) Rosikiewicz, Marta; Jarmołowski, Artur. PromotorMutant abh1 Arabidopsis thaliana posiadający insercję T-DNA w genie kodującym mniejszą podjednostkę jądrowego kompleksu wiążącego się z kapem (CBC) wykazuje nadwrażliwość na kwas abscysynowy (ABA) podczas kiełkowania nasion. W celu poznania zmian towarzyszących odmiennej odpowiedzi tego mutanta na ABA w niskim stężeniu przeprowadziliśmy analizę mikromacierzową z użyciem mikromacierzy tilingowych transkryptomu nasion mutanta abh1 i roślin typu dzikiego kiełkujących w obecności ABA i bez. Uzyskane przez nas wyniki wskazują, że w nasionach mutanta pod wpływem ABA dochodzi do silnej aktywacji transpozonów. Analizę genów ulegających różnicowej ekspresji przeprowadzono za pomocą nowego algorytmu opartego na pozycjach Difference of Rank Products (DRP), który jak udowodniłam najlepiej nadaje się do analizy eksperymentów mikromacierzowych z niewielką liczbą powtórzeń. W celu poznania genów, które współuczestniczą z kompleksem CBC w przekazywaniu sygnału ABA przeprowadziliśmy mutagenezę chemiczną mutanta abh1, dzięki której udało nam się uzyskać 5 linii supresorowych o zniesionej nadwrażliwości nasion na ABA. Mutacja w linii A21 została zmapowana do dolnego ramienia chromosomu II, co doprowadziło nas do odkrycia mutacji punktowej w genie ABI5. Sekwencjonowanie genów ABI4 i ABI5 ujawniło istnienie mutacji nonsensowych w genie ABI4 w dwóch innych liniach supresorowych.