Browsing by Author "Sadowski, Jan Wiktor. Promotor"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Charakterystyka fosfoproteomu jądrowego komórek linii T87 Arabidopsis thaliana(2013-07-02) Ibragimow, Izabela; Sadowski, Jan Wiktor. PromotorOdwracalna fosforylacja białek jest procesem dynamicznym, któremu w różnym czasie i różną intensywnością podlega 25%-50% białek komórki. Za katalizę tego procesu odpowiadają kinazy (fosforylacja) i fosfatazy (defosforylacja) białkowe. Współczesne metody identyfikacji PTM oparte są głównie na analizach spektrometrii mass (MS, ang. mass spectrometry), dzięki którym możliwe stało się monitorowanie ogólnego poziomu zmian fosforylacji białek w związku ze zmianami stanu fizjologicznego komórki. W niniejszej pracy materiałem wyjściowym analiz fosfoproteomicznych były jądra komórkowe zawiesiny komórkowej linii T87 A. thaliana. Fosforylowane białka identyfikowano z wykorzystaniem technik wzbogacania fosfopeptydów typu MOAC oraz analizie MS/MS. W wyniku analiz jakościowych zidentyfikowano 356 fosfobiałek jądrowych związanych z procesami dojrzewania pre-mRNA (splicing) i pre-rRNA (biosynteza rybosomów). Wśród tych białek, 60 nie było wcześniej opisanych jako ufosforylowane lub zidentyfikowano dla nich nowe miejsca fosforylacji. Wskazano także, 47 białek, które mogą być de- lub fosforylowane w sygnalizacji stresu solnego. Analizy ilościowe poziomu białek jądrowych po dwugodzinnym stresie solnym wykazały obniżenie ekspresji białek jąderkowych związanych z syntezą i dojrzewaniem cząsteczek rRNA. Ponadto, wykorzystując nadekspresję fosfatazy białkowej ABI1 zidentyfikowano białka podjednostki proteasomu 20S, które mogą być defosforylowane przez tą fosfatazę. Wykazano także, po raz pierwszy, że fosfataza ta może podlegać odwracalnej fosforylacji w części końca N białka.