Browsing by Author "Boeva, Valentina. Promotor"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Charakterystyka molekularna i funkcjonalna białek transbłonowych 72 i 207 oraz ich deregulacja w raku jasnokomórkowym nerki(2022) Pstrąg, Natalia; Wesoły, Joanna. Promotor; Boeva, Valentina. PromotorRak jasnokomórkowy (ccRCC) jest jednym z najczęściej występujących typów raka nerki. Obecnie nie są znane żadne biomarkery ccRCC a najczęstszą jego przyczyną jest mutacja genu VHL. Nie tłumaczy ona jednak wszystkich mechanizmów prowadzących do rozwoju i progresji ccRCC. W wyniku przeprowadzonych wcześniej metaanaliz ekspresji genów i doświadczeń wybrane zostały geny, których ekspresja w ccRCC jest znacząco deregulowana. Wybrane geny kodują białka należące do rodziny białek transmembranowych (TMEM). Spośród nich wybrano TMEM72 i TMEM207 w celu scharakteryzowania budowy i funkcji białek w zdrowym organizmie oraz zbadania mechanizmu deregulacji ich ekspresji w raku jasnokomórkowym nerki. W pierwszym kroku dokonano walidacji predykcji bioinformatycznych dotyczących lokalizacji i orientacji w błonie białek TMEM72 i TMEM207. Kolejno potwierdzono ekspresję TMEM72 oraz TMEM207 w guzach a także w liniach komórkowych. Udowodniono obecność dwóch isoform TMEM72 w tkankach raka jasnokomórkowego nerki. Dalej, przeprowadzono eksperymenty RNA-Seq, w celu ustalenia ich zaangażowania w szlaki sygnalizacyjne i metaboliczne oraz konsekwencji warunków stresowych występujących w guzach, świadczące o ich potencjalnej funkcji w organizmie. Równocześnie, przeprowadzono analizy bioinformatyczne na danych uzyskanych samodzielnie, jak również pozyskanych z dostępnych baz danych. Pokazano potencjalną korelację TMEM72 ze zwiększoną infiltracją guza przez regulatorowe komórki T. Wyniki niniejszej pracy posłużą do opisu budowy białek TMEM72 i TMEM207 oraz w przyszłości, do scharakteryzowania ich funkcji.