Browsing by Author "Pluskota-Karwatka, Donata. Promotor"
Now showing 1 - 5 of 5
Results Per Page
Sort Options
Item Fluorinated phosphonate analogues of phenylalanine – synthesis, structural studies and reactivity(2017) Kwiczak, Joanna Marianna; Pluskota-Karwatka, Donata. Promotor; Pirat, Jean-Luc. Promotorα-Aminophosphonates containing in their structure fluorine atom(s) are bioactive compounds. Due to their biological and pharmacological activities, they have found a wide range of applications in medicinal and agricultural chemistry. First aim of the doctoral dissertation was the synthesis and structural characterization of phosphonate analogues of phenylalanine containing in the phenyl ring different number of fluorine atoms, as potential inhibitors of aminopeptidase. α-Aminophosphonates were synthesized by one-pot two steps reaction. First, imine was generated, followed by the nucleophilic addition of diethyl phosphite. What is more, a convenient method for the synthesis of fluorinated aldehydes, which were not commercially available, was developed. In this work, novel monodeprotection method of diethyl phosphonate group by LiI leading to corresponding monosalt, and deprotection by Me3SiBr resulted in aminophosphonic acid, were developed. Additionally, reactivity of α-aminophosphonates towards aromatic nucleophilic substitution was studied. A large library of para substituted fluorinated analogues of phenylalanine was synthesized in the reactions with different nucleophiles such as thiolates, amines and phenolates.Item Modyfikacje strukturalne zasad DNA i aminokwasów powstające pod wpływem działania dwufunkcyjnych związków karbonylowych(2018) Muńko, Malwina; Pluskota-Karwatka, Donata. Promotor; Szwajca, Anna. Promotor pomocniczyProcesy komórkowe zachodzące w organizmie mogą być źródłem wysoce reaktywnych dwufunkcyjnych związków karbonylowych. Związki takie powstają, między innymi, w wyniku peroksydacji lipidów oraz podczas enzymatycznego utleniania furanu i jego pochodnych. Elektrofilowy charakter dwufunkcyjnych związków karbonylowych powoduje, że mogą one reagować z nukleofilowymi biocząsteczkami takimi jak aminokwasy białek lub zasady DNA, tworząc odpowiednie addukty. Modyfikacja strukturalna białek prowadzi do zmian w ich strukturze, a tym samym do utraty aktywności biologicznej. Uszkodzenia w DNA związane z tworzeniem adduktów mają charakter przedmutacyjny i jeśli nie zostaną usunięte, mogą wpłynąć na zapoczątkowanie procesu mutagenezy i kancerogenezy. Dynamika tego procesu jest zależna od struktury adduktów, ich trwałości oraz zdolności do rozpoznania przez systemy naprawy. Poznanie mechanizmów reakcji zachodzących w czasie tworzenia modyfikacji strukturalnych nukleofilowych biopolimerów, jak również podczas ich ewentualnego przekształcania jest ważnym krokiem do zrozumienia właściwości mutagennych pochodnych karbonylowych. Istotę pracy stanowiły badania reaktywności modelowego oksoenalu (5,5-dietoksy-4-oksopent-2-enalu, DOPE) wobec ważnych dla organizmów żywych cząsteczek, charakterystyka powstałych produktów z wykorzystaniem różnych technik spektralnych oraz zaproponowanie mechanizmów reakcji zachodzących w czasie tworzenia tych produktów. W toku badań podczas realizacji projektu doktorskiego dokonano syntezy adduktów powstających w reakcji 5,5-dietoksy-4-oksopent-2-enalu z 2’-deoksycytydyną, 2’-deoksyadenozyną oraz 2’-deoksyguanozyną. Otrzymane oksadiazabicyklooktaiminowe produkty zidentyfikowano metodami spektrometrycznymi oraz spektroskopowymi. W celu pogłębienia wiedzy dotyczącej mechanizmów tworzenia tych pochodnych przeprowadzono także obliczenia kwantowo-chemiczne metodami DFT. Otrzymane addukty poddano również badaniom trwałości. Stwierdzono, że addukty 2’-dC (DOPE-DC-1A, 1B, Schemat 1) ulegają w pH fizjologicznym degradacji z utworzeniem 2’-deoksycytydyny i 2’-deoksyurydyny (Schemat 1). Fakt ten przyczynił się do podjęcia prac badawczych dotyczących trwałości produktów reakcji 2’-deoksycytydyny z metabolitem furanu (cis-2-buten-1,4-dialem), będących analogami strukturalnymi adduktów DOPE-DC-1A, 1B. Zgodnie z oczekiwaniem, addukty BDA-DC-1A, 1B ulegały rozpadowi, któremu towarzyszyła deaminacja powstającej 2’-deoksycytydyny.Item Połączenia krzyżowe pochodnych cysteiny z aldehydowymi adduktami nukleozydów adeninowych(2016) Salus, Kinga Barbara; Pluskota-Karwatka, Donata. Promotor; Siodła, Tomasz. PromotorAddukty aldehydu malonowego i glioksalu oraz odpowiednio metyloglioksalu z nukleozydami adeninowymi zawierają w swojej strukturze α,β-nienasycone ugrupowanie karbonylowe, które może ulegać reakcjom z grupami nukleofilowymi biocząsteczek tworząc wiązania krzyżowe. Celem rozprawy było zbadanie możliwości tworzenia modelowych połączeń krzyżowych typu DNA-białko oraz RNA-białko w wyniku reakcji wspomnianych adduktów z grupami tiolowymi N-acetylocysteiny (NAC) i glutationu (GSH). Zsyntezowane addukty adenozyny i 2’-deoksyadenozyny z aldehydem malonowym i glioksalem (M1Gx-A) oraz metyloglioksalem (M1MGx-dA) poddano szczegółowym badaniom strukturalnym (NMR i DFT-GIAO). W wyniku przeprowadzonych badań reaktywności M1Gx-A, M1MGx-dA, M1MGx-Ade i M1MGx-A wobec NAC otrzymano i scharakteryzowano strukturalnie (1D i 2D NMR) szereg produktów stanowiących modelowe połączenia krzyżowe. Związki te okazały się stosunkowo trwałe w warunkach fizjologicznych, jednak w obecności Nα-acetylolizyny ulegały szybkiej przemianie w pochodne tego aminokwasu. Przedstawiono również rezultaty badań reaktywności M1Gx-A i M1MGx-A wobec GSH. Szereg produktów powstających w tych reakcjach scharakteryzowano na podstawie analiz LC-MS, wskazując, że zarówno grupa tiolowa, jak i aminowa glutationu biorą udział w tworzeniu połączeń krzyżowych typu DNA-białko i RNA-białko.Item Przemiany wybranych statyn syntetycznych zachodzące pod wpływem promieniowania elektromagnetycznego(2019) Jarmużek, Dorota; Pluskota-Karwatka, Donata. PromotorStatyny, inhibitory reduktazy HMG-CoA to grupa leków szeroko stosowanych w obniżaniu poziomu cholesterolu we krwi. Statyny syntetyczne wykazują znaczną podatność na działanie promieniowania świetlnego. Leki te zostały również wykryte w wodach powierzchniowych oraz gruntowych. Obecność statyn w zbiornikach wodnych może stanowić zagrożenie dla zdrowia ludzi i zwierzat. Celem niniejszej pracy było zbadanie wpływu promieniowania UV-Vis na trwałość fluwastatyny oraz pitawastatyny. W wyniku zrealizowanych badań określono podstawowe właściwości fotofizyczne i fotochemiczne obu badanych związków, zdefiniowano ich pierwotne produkty fotodegradacji Ponadto stosując metody eksperymentalne i obliczenia kwanotowo-chemiczne zaproponowano schemat pierwotnych przemian fluwastatyny oraz pitawastatyny zachodzących pod wpływem promieniowania UV-Vis oraz mechanizmy powstawania ich pierwotnych produktów. Istotą pracy stanowiły również badania wpływu promieniowania jonizującego na rosuwastatynę. Określono optymalną dawkę promieniowania powodującą degradację tej statyny. Ponadto otrzymano szereg produktów jej degradacji oraz zaproponowano schemat przemian rosuwastatyny zachodzących pod wpływem promieniowania gamma w warunkach utleniających. Otrzymane w ramach niniejszej dane dotyczące wpływu promieniowania UV-Vis na badane statyny mogą mieć istotne znaczenie m.in. dla procesu produkcji lub dawkowania tych leków. Uzyskane wyniki dotyczące wpływu promieniowania jonizującego na degradację statyn mogą być podstawą do rozwinięcia bardziej skutecznych metod oczyszczania ścieków.Item Synteza, reaktywność oraz zastosowanie fluorowanych fosfonianowych analogów homofenyloalaniny i fenyloglicyny(2017) Pawłowska, Agata Maria; Pluskota-Karwatka, Donata. PromotorFluorowane aminofosfoniany oraz kwasy aminofosfonowe jako strukturalne analogi aminokwasów odgrywają znaczącą rolę w syntezie organicznej, ze względu na możliwość wykazywania przez tego typu cząsteczki potencjalnej aktywności biologicznej. Oprócz syntezy, zasadniczą rolę odgrywa sposób wprowadzenia biocząsteczek do organizmu. Jedną z możliwości jest zastosowanie nanorurek węglowych. Celem niniejszej rozprawy były badania dotyczące syntezy, reaktywności oraz zastosowania fluorowanych fosfonianowych analogów fenyloglicyny oraz homofenyloalaniny. W toku realizowanych prac badawczych zsyntezowano bibliotekę fluorowanych α-aminofosfonianów. Następnie, poddano je reakcjom aromatycznej substytucji nukleofilowej, reakcjom dealkilowania oraz zastosowano w syntezie dipeptydów. Co istotne, wybrane α-aminofosfoniany poddano badaniom aktywności cytotoksycznej. Przeprowadzono także funkcjonalizacje kowalencyjne oraz niekowalencyjne nanorurek węglowych z wykorzystaniem fluorowanych aminofosfonianów. W toku badań ustalono czynniki wpływające na przebieg funkcjonalizacji niekowalencyjnej oraz porównano funkcjonalizacje kowalencyjne zachodzące z udziałem reakcji Tour’a, z tymi wykorzystującymi reakcje Kabachnika-Fields’a. Funkcjonalizacja nanorurek węglowych przy wykorzystaniu fluorowanych α-aminofosfonianów może być alternatywą do szybkiej modyfikacji powierzchni CNTs do celów biomedycznych.