Synteza i ustalenie korelacji struktura-aktywność biologiczna nowych pochodnych 14- i 15-członowych antybiotyków makrolidowych zawierających przebudowane ramiona sacharydowe
Loading...
Date
2021
Authors
Editor
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Title alternative
Synthesis and determination of a structure-biological activity correlation of new derivatives of 14- and 15- membered macrolide antibiotics containing remodeled saccharide arms
Abstract
Celem niniejszej rozprawy doktorskiej było zsyntezowanie nowych pochodnych 14- i 15-członowych laktonowych antybiotyków makrolidowych, zawierających przebudowane ramiona sacharydowe oraz funkcjonalizacja aglikonu klarytromycyny i ocena jej przydatności do dalszych zastosowań w poszukiwaniu nowych antybiotyków. W wyniku pracy otrzymano 50 nowych pochodnych, w tym 18 węglanowo-triazolowych analogów azytromycyny otrzymanych w wyniku reakcji 1,3-dipolarnej cykloaddycji Huisgena, 23 nowe sole N-alkiloamoniowe azytromycyny, 6 nowych soli N-alkiloamoniowych klarytromycyny oraz 3 związki hybrydowe powstałe w wyniku połączenia modyfikowanych antybiotyków makrolidowych z alkaloidem – kolchiceiną. Dodatkowo, przeprowadzono również syntezę nowego związku o nietypowej strukturze, stanowiącego alternatywną platformę do dalszej transformacji. Wszystkie struktury nowych pochodnych zostały ustalone na podstawie analizy spektroskopowe, z wykorzystaniem technik: 1H, 13C, 1H-1H COSY, 1H-1H NOESY, 1H-13C HSQC i 1H-13C HMBC, FT-IR, ESI-MS oraz modelowania molekularnego jedną z metod DFT. Ustalona została zależność pomiędzy strukturą nowo otrzymanych pochodnych a ich aktywnością przeciwbakteryjną i cytotoksycznością. Dodatkowo wyniki te zostały skorelowane z wyznaczonymi parametrami fizykochemicznymi, tj. z clogP i rozpuszczalnością w wodzie oraz modelem wiązania tych antybiotyków w tunelu rybosomalnym.
The aim of this doctoral dissertation was to synthesize new derivatives of 14- and 15-membered macrolide lactone antibiotics containing remodeled saccharide arms and functionalisation of the clarithromycin aglycone and evaluation of its suitability for further applications in the search for new antibiotics. As a result, 50 new derivatives were obtained, including 18 carbonate-triazole analogs of azithromycin synthesized in Huisgen's 1,3-dipolar cycloaddition reaction, 23 new N-alkylammonium azithromycin salts, 6 new N-alkylammonium clarithromycin salts and 3 hybrid compounds resulting from the combination of modified macrolide antibiotics with the alkaloid - colchiceine. In addition, synthesis of a new compound with an unusual structure was performed, constituting an alternative platform for further transformation. All the structures of new derivatives were determined on the basis of spectroscopic analysis, using the techniques: 1H, 13C, 1H-1H COSY, 1H-1H NOESY, 1H-13C HSQC and 1H-13C HMBC, FT-IR, ESI-MS and molecular modeling with one of the DFT methods. Relationship between the structure of the newly obtained derivatives and their antibacterial activity and cytotoxicity was established. Additionally, these results were correlated with the determined physicochemical parameters, i.e. clogP and water solubility and with the model of binding these antibiotics in the ribosomal tunnel.
The aim of this doctoral dissertation was to synthesize new derivatives of 14- and 15-membered macrolide lactone antibiotics containing remodeled saccharide arms and functionalisation of the clarithromycin aglycone and evaluation of its suitability for further applications in the search for new antibiotics. As a result, 50 new derivatives were obtained, including 18 carbonate-triazole analogs of azithromycin synthesized in Huisgen's 1,3-dipolar cycloaddition reaction, 23 new N-alkylammonium azithromycin salts, 6 new N-alkylammonium clarithromycin salts and 3 hybrid compounds resulting from the combination of modified macrolide antibiotics with the alkaloid - colchiceine. In addition, synthesis of a new compound with an unusual structure was performed, constituting an alternative platform for further transformation. All the structures of new derivatives were determined on the basis of spectroscopic analysis, using the techniques: 1H, 13C, 1H-1H COSY, 1H-1H NOESY, 1H-13C HSQC and 1H-13C HMBC, FT-IR, ESI-MS and molecular modeling with one of the DFT methods. Relationship between the structure of the newly obtained derivatives and their antibacterial activity and cytotoxicity was established. Additionally, these results were correlated with the determined physicochemical parameters, i.e. clogP and water solubility and with the model of binding these antibiotics in the ribosomal tunnel.
Description
Wydział Chemii
Sponsor
Praca doktorska wykonana w ramach projektu finansowanego przez: Narodowe Centrum Nauki OPUS 10 nr grantu: UMO/2015/19/B/ST5/00231.
Keywords
antybiotyki, chemia „click”, czwartorzędowanie atomu azotu, właściwości przeciwbakteryjne, interakcje antybiotyk-rybosom, antibiotics, “click” chemistry, nitrogen quaternization, antibacterial properties, antibiotic-ribosome interactions