Doktoraty (WB)
Permanent URI for this collection
Browse
Browsing Doktoraty (WB) by Author "Bajczyk, Mateusz"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Rola kompleksu NEXT w biogenezie mikroRNA(2019) Bajczyk, Mateusz; Jarmołowski, Artur. PromotorSERRATE (SE) jest białkiem ważny dla powstawania mikroRNA u Arabidopsis, jednakże jest również zaangażowane w inne procesy związane z RNA, między innymi: wycinanie intronów z pre-mRNA. W celu zrozumienia tej wielofunkcyjnej roli SE przeprowadzono jego koimmunoprecypitacje i zidentyfikowano partnerów białkowych SE z użyciem LC-MS/MS. Wśród zidentyfikowanych białek były między innymi wszystkie podjednostki kompleksu NEXT (ang. Nuclear Exosome Targeting): HEN2, ZCCHC8A, ZCCHC8B, RBM7. NEXT jest kompleksem wyszukującym RNA przeznaczone do degradacji przez egsozom RNA od strony 3’. Następnie z użyciem sekwencjonowania nowej generacji wykazano, że kompleks NEXT jest odpowiedzialny za degradacje pri-miRNA. Analiza podwójnych mutantów, w których poza zaburzoną biogenezą miRNA była również spowolniona degradacja pri-miRNA (hyl1-2 hen2-2, se-2 hen2-2) wykazała poprawę fenotypu roślina wraz z podniesionym poziomem miRNA. Dodatkowo zaobserwowano również bardzo wysoką akumulacje pri-miRNA. Dane te pokazują, że brak degradacji pri-miRNA skutkuje lepszą produkcją miRNA przez DCL1 mimo braku elementów go wspomagających. Zaproponowany na podstawie wyników tej rozprawy doktorskiej model zakłada, że białko SE jest zaangażowane w biogenezę miRNA w dwóch płaszczyznach. W jednej pomaga białku DCL1 w efektywnym i dokładnym cięciu pri-miRNA, natomiast w drugiej płaszczyźnie promuje degradacje nadmiaru pierwotnych prekursorów miRNA przez rekrutacje kompleksu NEXT.