Doktoraty (WB)
Permanent URI for this collection
Browse
Browsing Doktoraty (WB) by Author "Bielewicz, Dawid"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Transkrypcyjna i potranskrypcyjna regulacja biogenezy mikroRNA u Arabidopsis thaliana(2015-06-19) Bielewicz, Dawid; Szweykowska-Kulińska, Zofia. Promotor; Vazquez, Franck. PromotorMikroRNA zostały zidentyfikowane u prawie wszystkich przedstawicieli grup organizmów eukariotycznych i są uważane za fundamentalne elementy regulacji ekspresji genów. Wiele roślinnych genów mikroRNA zawiera introny. Wiadomo, że obecność intronów w genach kodujących białka bardzo często prowadzi do alternatywnego splicingu pre-mRNA, a co za tym idzie, do zwiększenia różnorodności powstających białek z jednego genu. Odnośnie genów MIR funkcjonalną cząsteczką jest krótki (19-24 nt) RNA. Występowania intronów w takim przypadku nie można wytłumaczyć możliwością zwiększenia repertuaru kodowania różnych mikroRNA. Potwierdzają to wyniki sekwencjonowania całkowitej puli krótkich RNA u Arabidopsis thaliana. Postawione zostało pytanie: czy obecność intronów w genach i pierwotnych transkryptach tych genów ma wpływ na poziom dojrzałych cząsteczek miRNA? W pracy tej, na podstawie dwóch przykładów genów MIR zawierających introny, (MIR163 i MIR161) wykazano, że introny w genach MIR są istotne do prawidłowej ekspresji dojrzałych cząsteczek mikroRNA.Usunięcie sekwencji intronu z genu MIR prowadzi do obniżenia ekspresji dojarzałej cząsteczki mikroRNA pochodzącej z danego genu. Efekt stymulacji dojrzewania mikroRNA jest związany przede wszystkim z funkcjonalnym miejscem 5’ splicingowym. Dodatkowo mutacja miejsca splicingowego 5` prowadzi do zaburzenia w wyborze miejsca poliadenylacji w pierwotnym transkrypcje genu MIR. Ponadto obecność miejsc splicingowych w pierwotnym transkrypcie genu MIR163 okazała się niezbędna w odpowiedzi rośliny na stres biotyczny. Brak miejsc splicingowych podczas ataku patogena nie wywołuje stymulacji ekspresji mikroRNA163, co w konsekwencji prowadzi do nieprawidłowej regulacji genu docelowego działania dla tego mikroRNA.