Wykorzystanie metod obliczeniowych mechaniki klasycznej i kwantowej w komputerowo wspomaganym projektowaniu leków

Simple item page
dc.contributor.advisorHoffmann, Marcin. Promotor
dc.contributor.authorNowosielski, Marcin
dc.date.accessioned2015-06-24T09:09:24Z
dc.date.available2015-06-24T09:09:24Z
dc.date.issued2015-06-24
dc.descriptionWydział Chemiipl_PL
dc.description.abstractKomputerowo wspomagane projektowanie leków (ang. Computer Aided Drug Design - CADD) to młoda dziedzina nauki łączącą zdobycze wiedzy z zakresu mechaniki klasycznej i kwantowej, uczenia maszynowego oraz analizy danych. Badania CADD zapoczątkowano we wczesnych latach 60-tych, a sektor prywatny szybko rozpoznał ich wielki potencjał komercyjny. Na korzyść metod obliczeniowych przemawiają bowiem zarówno o wiele niższe koszta, jak i znacząco skrócony czas eksperymentu. Na dzień dzisiejszy każdy ze znaczących koncernów farmaceutycznych posiada w swych strukturach jednostkę dedykowaną badaniom in sillico. W niniejszej pracy przedstawione zostało podsumowanie mojego dotychczasowego dorobku naukowego, drogi która doprowadziła do wytypowania nowej, potencjalnej substancji przeciwgruźliczej. W pierwszych trzech rozdziałach czytelnik odnajdzie minimum podstaw teoretycznych, których zrozumienie należy uznać za kluczowe. Kolejna z sekcji stanowi zwięzłe omówienie opublikowanych przeze mnie artykułów badawczych, z uwzględnieniem ogólnych idei oraz ich ograniczeń. W opinii autora żadna metoda obliczeniowa sama w sobie nie jest w stanie sprostać wyzwaniom narzucanym przez CADD, a najdokładniejsze wyniki uzyskać można jedynie poprzez umiejętne połączenie kilku podejść. Ostatni z rozdziałów poświęcony został potencjalnym kierunkom przyszłego rozwoju. pl_PL
dc.description.abstractComputer Aided Drug Design (CADD) is a modern discipline, which combines such fields of science as quantum and classical mechanics, data analysis and machine learning. Its origins can be traced back to the early 1960's, and it was not long before a great practical potential of CADD had been recognized. Currently, all major pharmaceutical companies have CADD units in their structure. Thanks to the in silico techniques new active substances can be design not only faster but also at much lower costs. Here I present a summary of my research experience, a route that led to an identification of a new antituberculosis agent. In particular the focus is put on a combination of quantum and classical methods which complement each other. In the first three chapters one can find a brief sketch of quantum and classical, as well as docking methods, which understanding is absolutely crucial. Following, I guide the reader through my articles, with an emphasis on general ideas, limitations and strategies. The main conclusion draw from the studies is that none of the existing methods alone is sufficient. It is rather a smart combination of them that need to be employed. Yet, it seems that researcher’s intuition and experience remain crucial factors. In the last chapter one can find a brief description of possible directions for future development.pl_PL
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10593/13364
dc.language.isoplpl_PL
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesspl_PL
dc.subjectmechanika klasycznapl_PL
dc.subjectclassical mechanicspl_PL
dc.subjectmechanika kwantowapl_PL
dc.subjectquantum mechanicspl_PL
dc.subjectdokowaniepl_PL
dc.subjectdockingpl_PL
dc.subjectmetody łączonepl_PL
dc.subjectcombined methodspl_PL
dc.subjectprojektowanie lekówpl_PL
dc.subjectdrug designpl_PL
dc.titleWykorzystanie metod obliczeniowych mechaniki klasycznej i kwantowej w komputerowo wspomaganym projektowaniu lekówpl_PL
dc.title.alternativeQuantum and classical mechanics methods in computer aided drug designpl_PL
dc.typeDysertacjapl_PL

Files

Collections

Doktoraty 2010-2025 /dostęp ograniczony, możliwy z komputerów w Bibliotece Uniwersyteckiej/
Doktoraty (WCH)