Analiza proteomiczna kompleksów tworzonych przez białko hDPY30 w komórkach ludzkich
Loading...
Date
2016
Authors
Advisor
Editor
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Title alternative
Proteomic analysis of complexes formed by hDPY30 in human cells
Abstract
Białko hDPY30 jest podjednostką rdzeniową wszystkich poznanych kompleksów metylujących lizynę 4 histonu 3 w komórkach ludzkich i zaangażowane jest w epigenetyczną regulację ekspresji genów. Białko to zlokalizowane jest również w cytoplazmie, gdzie uczestniczy w transporcie endosomalnym. W celu poznania nowych funkcji hDPY30 oraz identyfikacji białek, które mogą regulować aktywność kompleksów metylotransferaz histonowych H3K4 przeprowadzono izolację kompleksów tworzonych przez to białko w komórkach ludzkich. Wykazano, że hDPY30 oddziałuje z dużą grupą białek jądrowych i cytoplazmatycznych zaangażowanych w regulację transkrypcji i struktury chromatyny, transdukcję sygnału, transport endosomalny oraz modyfikację cytoszkieletu aktynowego. Jedno ze zidentyfikowanych białek, AKAP8L oddziałuje ze wszystkimi podjednostkami rdzeniowymi kompleksów metylotransferaz histonowych H3K4, co sugeruje, że może być regulatorem tych kompleksów. Analiza funkcjonalna interakcji hDPY30 z białkami jądrowymi AKAP8 i BEND3, wykazała, że hDPY30 prawdopodobnie uczestniczy w regulacji transkrypcji genów rRNA. Natomiast, zidentyfikowane bezpośrednie oddziaływanie hDPY30 z białkami srGAP2 i Caskin1 zaangażowanymi w transdukcję sygnału oraz regulację procesu migracji i adhezji komórek wskazuje na niezidentyfikowane dotąd funkcje cytoplazmatyczne białka hDPY30.
hDPY30 is a component of all known histone methyltransferase complexes responsible for histone H3 lysine 4 methylation in human cells and it is involved in the epigenetic regulation of gene expression. hDPY30 is also present in the Golgi apparatus and participates in the endosomal transport of proteins. To reveal novel functions of hDPY30 and identify novel potential regulatory proteins associated with H3K4 HMT complexes through the interaction with DPY30, the tandem affinity purification and MS analysis of complexes formed by hDPY30 in human cells was performed. The performed analysis showed that hDPY30 interacts with a large group of nuclear and cytoplasmic proteins involved in the regulation of chromatin structure and transcription, signal transduction, endosomal transport and modification of actin cytoskeleton. One of the hDPY30-associated proteins, AKAP8L, interacts with core subunits of SET1/MLL complexes, which suggests that it may regulate the function of these complexes. Functional analysis of interaction between hDPY30 and two nuclear proteins: AKAP8 and BEND3, showed that hDPY30 may be engaged in regulation of rRNA genes transcription. Moreover, direct interaction of DPY30 with srGAP2 and Caskin1, two cytoplasmic proteins involved in cell migration/adhesion and signal transduction, indicates that hDPY30 also influences additional processes that occur in the cytoplasm.
hDPY30 is a component of all known histone methyltransferase complexes responsible for histone H3 lysine 4 methylation in human cells and it is involved in the epigenetic regulation of gene expression. hDPY30 is also present in the Golgi apparatus and participates in the endosomal transport of proteins. To reveal novel functions of hDPY30 and identify novel potential regulatory proteins associated with H3K4 HMT complexes through the interaction with DPY30, the tandem affinity purification and MS analysis of complexes formed by hDPY30 in human cells was performed. The performed analysis showed that hDPY30 interacts with a large group of nuclear and cytoplasmic proteins involved in the regulation of chromatin structure and transcription, signal transduction, endosomal transport and modification of actin cytoskeleton. One of the hDPY30-associated proteins, AKAP8L, interacts with core subunits of SET1/MLL complexes, which suggests that it may regulate the function of these complexes. Functional analysis of interaction between hDPY30 and two nuclear proteins: AKAP8 and BEND3, showed that hDPY30 may be engaged in regulation of rRNA genes transcription. Moreover, direct interaction of DPY30 with srGAP2 and Caskin1, two cytoplasmic proteins involved in cell migration/adhesion and signal transduction, indicates that hDPY30 also influences additional processes that occur in the cytoplasm.
Description
Wydział Biologii
Sponsor
Keywords
hDPY30, metylotransferazy, H3K4 histone methyltransferases, metylotransferazy histonowe H3K4, rDNA, AKAP8, BEND3