Genome-wide characterization of STAT1 and NFκB-mediated Signal Integration in Vascular Inflammation
| dc.contributor.advisor | Bluyssen, Johannes A.R. Promotor | |
| dc.contributor.author | Piaszyk-Borychowska, Anna | |
| dc.date.accessioned | 2020-03-02T07:38:19Z | |
| dc.date.available | 2020-03-02T07:38:19Z | |
| dc.date.issued | 2020 | |
| dc.description | Wydział Biologii | pl |
| dc.description.abstract | Atherosclerosis is a leading cause of mortality world-wide. The key etiological factor is vascular inflammation, mediated by vascular smooth muscle cells and immune cells. Signal Integration (SI) between JAK-STAT and TLR4 signaling pathways plays a crucial role in pro-inflmmatory response. Genome-wide transcriptome (RNA-seq) and genome (ChIP-seq) analysis revealed, that synergistic IFNγ-, IFNα- and LPS-dependent activation of STAT1- and NFκB-containing transcriptional complexes binding to composite GAS/ISRE and NFκB sites in the close proximity on DNA, due to STAT1-dependent open chromatin state, underlies the mechanism of robust pro-inflammatory gene expression in vascular cells. Moreover, it was proposed the mechanism regulating SI between JAK-STAT and TLR4 pathways in the context of pro-inflammatory gene down-regulation, in which STAT1 and NFκB mediate negative histone mark deposition. Next, a role of STAT1 in IFNγ-dependent vascular smooth muscle cell-specific gene expression relying on hierarchical collaboration with cell type-specific transcription factor, was proposed. This research could be used in the future to develop new diagnostic and therapeutical strategies against atherosclerosis. | pl |
| dc.description.abstract | Miażdżyca naczyń krwionośnych stanowi główną przyczynę śmiertelności na świecie. Kluczowym czynnikiem etiologicznym jest stan zapalny w obrębie naczyń, mediowany przez komórki mięśniówki gładkiej naczyń krwionośnych i komórki układu odpornościowego. Istotną rolę w odpowiedzi zapalnej odgrywa integracja sygnałowa (SI) pomiędzy szlakami JAK-STAT oraz TLR4. Dzięki całogenomowej analizie transkryptomu (RNA-seq) oraz genomu (ChIP-seq) wykazano, że synergistyczna IFNγ-, IFNα- oraz LPS-zależna aktywacja kompleksów transkrypcyjnych zawierających białka STAT1 oraz NFκB, wiążących się do miejsc kompozytowych GAS/ISRE oraz NFκB w bliskiej odległości w łańcuchu DNA, dzięki STAT1-zależnej otwartej konformacji chromatyny, leży u podstaw mechanizmu potężnej ekspresji genów prozapalnych w komórkach mięśniówki gładkiej naczyń krwionośnych. Ponadto w pracy zaproponowano mechanizm regulujący SI pomiędzy szlakami JAK-STAT i TLR4 w kontekście obniżonej ekspresji genów prozapalnych, w którym białka STAT1 oraz NFκB pośredniczą w negatywnym znakowaniu histonów. Następnie zaproponowano rolę czynnika STAT1 w IFNγ-zależnej ekpresji genów, specyficznej dla komórek śródbłonka naczyń krwionośnych, potencjalnie zależną od hierarchicznego współdziałania z komórkowo-specyficznym czynnikiem transkrypcyjnym. Badania mogą w przyszłości zostać wykorzystane w diagnostyce oraz terapii miażdżycy. | pl |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10593/25464 | |
| dc.language.iso | eng | pl |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | pl |
| dc.subject | miażdżyca | pl |
| dc.subject | zapalenie naczyń krwionośnych | pl |
| dc.subject | interferony | pl |
| dc.subject | atherosclerosis | pl |
| dc.subject | vascular inflammation | pl |
| dc.subject | interferons | pl |
| dc.title | Genome-wide characterization of STAT1 and NFκB-mediated Signal Integration in Vascular Inflammation | pl |
| dc.title.alternative | Całogenomowa analiza integracji szlaków sygnałowych czynników STAT1 i NFκB w procesie zapalnym naczyń krwionośnych | pl |
| dc.type | Dysertacja | pl |